VinDr Lab – Công cụ mã nguồn mở phục vụ gán nhãn dữ liệu y tế

Một trong những thách thức lớn nhất hiện nay trong việc phát triển các công cụ chẩn đoán và phát hiện bệnh từ hình ảnh y khoa là việc thiếu các công cụ gán nhãn mở, hiệu quả với khả năng quản lý và gán nhãn các bộ dữ liệu quy mô lớn. Trước thực tế này, nhóm phần mềm của Phòng Xử lý ảnh y tế – Viện Nghiên cứu Dữ liệu lớn Vingroup (VinBigdata) quyết định mở toàn bộ mã nguồn của VinDr Lab – phần mềm gán nhãn dữ liệu y tế cho cộng đồng. 

Động lực phát triển

Đối với việc phát triển các ứng dụng Trí tuệ nhân tạo (AI), dữ liệu là yếu tố quan trọng. Để có dữ liệu sạch và có giá trị đối với các thuật toán thì dữ liệu cần được gán nhãn và chú giải bởi con người. 

Thực tế cho thấy, hiện đã có nhiều phần mềm mã nguồn mở phục vụ gán nhãn cho dữ liệu ảnh tự nhiên, âm thanh, văn bản. Tuy nhiên phần mềm mã nguồn mở cho ảnh y tế còn hiếm, đặc biệt, chưa có ứng dụng gán nhãn mở nào cho phép quản lý, phân công gán nhãn cho các bộ dữ liệu y tế có quy mô lớn.

Về giải pháp VinDr Lab

VinDr Lab là phần mềm mã nguồn mở cho phép quản lý và gán nhãn dữ liệu ảnh y tế. Phần mềm được VinBigdata phát triển để lược bỏ những khó khăn mà các kỹ sư, tổ chức gặp phải trong quá trình xây dựng các giải pháp y tế ứng dụng Trí tuệ nhân tạo. Người dùng hoàn toàn có thể tùy chỉnh mã nguồn để phục vụ các mục đích riêng của tổ chức, cá nhân. 

Hiện VinDr Lab đang hỗ trợ tính năng gán nhãn cho ảnh y khoa định dạng X-quang phổi, vú, xương. Nhóm hình ảnh y khoa định dạng chụp cắt lớp và cộng hưởng từ đang được phát triển, dự kiến sẽ cho ra mắt trong tương lai gần. Chia sẻ mã nguồn mở trên Github, các nhà phát triển VinDr Lab hy vọng sẽ được cộng đồng công nghệ đón nhận, và đóng góp để giải pháp trở nên hoàn thiện hơn. 

Tính năng của VinDr Lab

1. Quản lý dự án

  • Quản lý vòng đời của dữ liệu, dữ liệu được tổ chức theo đơn vị ca bệnh
  • Kiểm soát luồng làm việc (các bác sĩ làm việc độc lập hay cộng tác với nhau)
  • Theo sát tiến độ dự án qua trạng thái của từng nhiệm vụ

2. Quản lý gán nhãn

  • Tùy chỉnh các danh sách nhãn có sẵn hoặc tạo danh sách nhãn mới 
  • Tổ chức phân cấp nhãn bệnh
  • Sắp xếp thứ tự nhãn trong danh sách hiển thị

3. Công cụ chú thích

  • Có các công cụ cần thiết của một trình xem ảnh DICOM
  • Cho phép gãn nhãn với Bounding Box, Polygon hay Brush
  • Chú thích thêm cho nhãn được vẽ với các ghi chú và bình luận

4. Quản lý tác vụ 

  • Phân công lại những nhiệm vụ chưa đạt yêu cầu 
  • Theo dõi phân bố của nhãn bệnh 
  • Kiểm soát các phiên bản nhãn được xuất ra từ phần mềm

Giá trị VinDr Lab mang lại

  • Phần mềm là ứng dụng web, có thể được sử dụng để triển khai tại chỗ hoặc trên mạng. 
  • Vì là ứng dụng web, nên khi host public trên mạng, bất cứ ai có tài khoản cũng có thể tham gia, hợp tác gán nhãn, quản lý dữ liệu (online collaborating)
  • VinDr Lab luôn open với các yêu cầu về tính năng từ cộng đồng và tin rằng cộng đồng sẽ góp phần định hướng tương lai cho sản phẩm này.
  • Quy trình quản lý dự án gán nhãn với đầy đủ các tính năng cơ bản
    • Tổ chức dữ liệu phù hợp với lĩnh vực y tế
    • Công cụ quản lý, chia sẻ dữ liệu, nhãn bệnh
    • Theo sát tiến độ của dự án
    • Kiểm soát chất lượng của quá trình gán nhãn
  • Đóng góp cho cộng đồng một phần mềm mã nguồn mở
    • Là một phần trong các giải pháp toàn diện về y tế
    • Có thể tùy chỉnh mã nguồn để phục vụ các mục đích riêng của cá nhân, tổ chức

VinDr Lab dành cho ai?

  • Cá nhân và tổ chức nghiên cứu AI
  • Kỹ sư AI, phần mềm
  • Các công ty, tổ chức có nhu cầu gán nhãn dữ liệu y tế

VinDr Lab mở mã nguồn không thời hạn. Các tính năng mới của VinDr Lab sẽ được thông báo trên github chính và trang documentation. Các nhà phát triển có thể yêu cầu, thảo luận về các tính năng mới trên github issues hoặc gitter community. Đội ngũ phát triển hy vọng người dùng trên toàn cầu sẽ đóng góp cho sự phát triển của VinDr Lab vì cộng đồng.

Truy cập VinDr Lab tại

Project github chính cũng như các project thành viên có file hướng dẫn (README.md) để người dùng tham khảo. 

Chia sẻ:
Share on facebook
Share on twitter
Share on linkedin

Tin liên quan